短距離（たんきょり）フェリーとは、片道の距離が100㎞未満の旅客フェリーである。
| No. | 名称（愛称） | 航路 | 距離 | 乗船時間 | 船舶 | 運行会社 |
|---|
船フェリーwiki独自のナンバリングを使用
*1*2 |
| FH1 | 羽幌天売航路 | 羽幌港（北海道） - 焼尻港（焼尻島） - 天売港（天売島） | 35㎞ | 1時間 | 『さんらいなぁ2』「おろろん2」 | 羽幌沿海フェリー |
| FH2 | 利礼航路 | 稚内港（北海道） - 鴛泊港（利尻島） | 59㎞ | 1時間 | 「アマポーラ宗谷」「サイプリア宗谷」「ボレアース宗谷」 | ハートランドフェリー |
| FH3 | 利礼航路 | 稚内港（北海道） - 香深港（礼文島） | 52㎞ | 1時間55分 | 「アマポーラ宗谷」「サイプリア宗谷」「ボレアース宗谷」 | ハートランドフェリー |
| FH4 | 利礼航路 | 香深港（礼文島） - 鴛泊港（利尻島） | 19㎞ | 45分 | 「アマポーラ宗谷」「サイプリア宗谷」「ボレアース宗谷」 | ハートランドフェリー |
| FH5 | 利礼航路 | 香深港（礼文島） - 沓形港（利尻島） | 19㎞ | 40分 | 「アマポーラ宗谷」「サイプリア宗谷」「ボレアース宗谷」 | ハートランドフェリー |
| FH6 | 奥尻航路 | 江差港（北海道） - 奥尻港（奥尻島） | 61㎞ | 2時間10分 | 「カランセ奥尻」 | ハートランドフェリー |
| FH7 | 祝津航路 | 小樽港（北海道） - 祝津港（北海道） | | 20分 | 「あおばと」 | 小樽海上観光船 |
| No. | 名称（愛称） | 航路 | 距離 | 乗船時間 | 船舶 | 運行会社 |
|---|
船フェリーwiki独自のナンバリングを使用
*3*4 |
| FX5 | 大函航路（ノスタルジック航路） | 大間港（青森県） - 函館港［七重浜］（北海道） | 40㎞ | 1時間30分 | 「大函丸」 | 函館海峡フェリー |
| No. | 名称（愛称） | 航路 | 距離 | 乗船時間 | 船舶 | 運行会社 |
|---|
船フェリーwiki独自のナンバリングを使用
*5*6 |
| FT1 | | 蟹田港（青森県） - 脇野沢港（青森県） | 22.6㎞ | 1時間 | 「かもしか」 | むつ湾フェリー |
| FT2 | | 佐井港（青森県） - 仏ヶ浦港（青森県） | | 30分 | 『ニューしもきた号Ⅰ』『ニューしもきた号Ⅱ』『ニューしもきた号Ⅲ』『ニューしもきた号Ⅳ』 | 仏ヶ浦海上観光 |
| FT3 | 下北半島西岸航路 | 脇野沢港（青森県） - 仏ヶ浦港（青森県） | | 45分 | 「夢の平成号」 | むつ市 |
| FT4 | | 牛滝港（青森県） - 仏ヶ浦港（青森県） | | | 「夢の海中号」 | 坂井幸人 |
| FT5 | | 出崎ふ頭発着場（岩手県） - 浄土ヶ浜発着場（岩手県） | | | 「宮古うみねこ丸」 | みやこ浄土ヶ浜遊覧船（岩手県北自動車） |
| FT6 | | 女川港（宮城県） - 江島港（江島） - 寺間港（出島） - 出島港（出島） - 女川港（宮城県） | 20.6㎞ | 1時間20分 | 「しまなぎ」 | シーパル女川汽船 |
| FT7 | | 女川港（宮城県） - 金華山港（金華山島） | | 40分 | 「べガ（織姫）」「アルティア（彦星）」 | 潮プランニング |
| FT8 | | 鮎川港（宮城県） - 金華山港（金華山島） | | 20分 | 「ホエール」 | 金華山観光 |
| FT9 | | 鮎川港（宮城県） - 金華山港（金華山島） | | 20分 | 「ドリーム」「シードリーム」 | 金華山フェリー |
| FT10 | | 石巻港［中央］（宮城県） - 石巻港［門脇］（宮城県） - 大泊港（田代島） - 仁斗田港（田代島） - 網地港（網地島） - 長渡港（網地島） - 鮎川港（宮城県） | 33㎞ | 1時間20分 | 『シーキャット』「マーメイドⅡ」 | 網代島ライン |
| FT11 | 浦戸諸島定期航路（浦戸しおさい海廊） | 塩釜港（宮城県） - 桂島桟橋（桂島） - 野々島桟橋（野々島） - 石浜桟橋（桂島） - 寒風沢島桟橋（寒風沢島） - 朴島桟橋（朴島） | 11.6㎞ | 52分 | 「うらと」「しおじ」「しおね」 | 塩竃市営汽船 |
| FT12 | 芭蕉コース | 塩釜港（宮城県） - 松島港（宮城県） | | 50分 | | 丸文松島汽船 |
| FT13 | | 松島港（宮城県） - 奥松島港（宮戸島） | | 25分 | 「第二嵯峨」「第五嵯峨」「嵯峨みらい」 | 東松島観光物産公社 |
| FT14 | | ホテル（宮城県） - 漁港岸壁（宮城県） | | | | 志津川湾観光船 |
| FT15 | | 酒田港（山形県） - 勝浦港（飛島） | 39.3㎞ | 1時間45分 | 「とびしま」 | 酒田市 |
| No. | 名称（愛称） | 航路 | 距離 | 乗船時間 | 船舶 | 運行会社 |
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| 船フェリーwiki独自のナンバリングを使用 |
| FK1 | | 久里浜港［横須賀港］（神奈川県） - 金谷港［浜金谷港］（千葉県） | 11.5㎞ | 40分 | 「かなや丸」「しらはま丸」 | 東京湾フェリー |
| FK2 | 猿島航路 | 三笠桟橋［横須賀港］（神奈川県） - 猿島桟橋（猿島） | 1.6㎞ | 10分 | 「ニュークロフネ」「シーフレンドゼロ」「シーフレンド7」「シーフレンド8」 | トライアングル |
伊豆・小笠原諸島 
| No. | 名称（愛称） | 航路 | 距離 | 乗船時間 | 船舶 | 運行会社 |
|---|
| 船フェリーwiki独自のナンバリングを使用 |
| FZ1 | | 二見港（父島） - 母島港（母島） | 40㎞ | 2時間 | 「ははじま丸」 | 小笠原海運 |
| FZ2 | | 下田港（静岡県） - 神津島港（神津島） - 野伏港（式根島）- 新島港（新島） - 利島港（利島） - 下田港（静岡県） | | 7時間 | 「あぜりあ丸」 | 神新汽船株式会社 |
| FZ3 | | 東京港（東京都） - 元町港（伊豆大島） | | | 『セブンアイランド愛』『セブンアイランド友』『セブンアイランド大漁』『セブンアイランド結』 | 東海汽船 |
| FZ4 | | 東京港（東京都） - 横須賀港［久里浜］（神奈川県） - 元町港（伊豆大島） | | | 『セブンアイランド愛』『セブンアイランド友』『セブンアイランド大漁』『セブンアイランド結』 | 東海汽船 |
| FZ5 | | 東京港（東京都） - 館山港（千葉県） - 元町港（伊豆大島） | | | 『セブンアイランド愛』『セブンアイランド友』『セブンアイランド大漁』『セブンアイランド結』 | 東海汽船 |
| FZ6 | | 熱海港（静岡県） - 伊東港（静岡県） - 元町港（伊豆大島） | | | 『セブンアイランド愛』『セブンアイランド友』『セブンアイランド大漁』『セブンアイランド結』 | 東海汽船 |
| FZ7 | | 東京港（東京都） - 横浜港（神奈川県） - 元町港（伊豆大島） - 利島港（利島） - 新島港（新島） - 野伏港（式根島） - 神津島港（神津島） | | 3時間10分 | 『セブンアイランド愛』『セブンアイランド友』『セブンアイランド大漁』『セブンアイランド結』「さるびあ丸」 | 東海汽船 |
| FZ8 | | 東京港（東京都） - 三池港／大久保港／伊ヶ谷漁港（三宅島） - 御蔵島港（御蔵島） - 底土港／八重根港（八丈島） | | 10時間25分 | 「橘丸」 | 東海汽船 |
| FZ9 | | 底土港（八丈島） - 三宝港（青ヶ島） | | | 「くろしお丸」 | 東海汽船 |
| FZ10 | | 新島（新島港） - 野伏港（式根島） | | 20分 | 「にしき」 | 東京都新島村 |
| No. | 名称（愛称） | 航路 | 距離 | 乗船時間 | 船名 | 運行会社 |
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船フェリーwiki独自のナンバリングを使用
*7*8*9*10*11 |
| FN1 | 粟島航路 | 岩船港（新潟県） - 粟島港（粟島） | 35.0㎞ | 1時間／1時間35分 | 『awalineきらら』「ニューあわしま」 | 粟島汽船 |
| FN2 | 新潟航路 | 新潟港（新潟県） - 両津港（佐渡島） | 67.2㎞ | 1時間7分／2時間30分 | 『ぎんが』『すいせい』『つばさ』「おけさ丸」「ときわ丸」 | 佐渡汽船 |
| FN3 | 直江津航路 | 直江津港（新潟県） - 小木港（佐渡島） | 78.0㎞ | 1時間40分 | 「こがね丸」 | 佐渡汽船 |
| FN4 | へぐら航路 | 輪島港（石川県） - 舳倉島港（舳倉島） | 50.0㎞ | 1時間25分 | 「希海」 | へぐら航路 |
| No. | 名称（愛称） | 航路 | 距離 | 乗船時間 | 船舶 | 運行会社 |
|---|
| 船フェリーwiki独自のナンバリングを使用 |
| FC1 | 初島航路 | 熱海港（静岡県） - 初島港（初島） | | 30分 | 『イル ド バカンス三世号』 | 富士急マリンリゾート |
| FC2 | 県道223(ふじさん)号 | 清水港（静岡県） - 土肥港（静岡県） | 30.2㎞ | 75分 | 「富士」 | ふじさん駿河湾フェリー |
| FC3 | | 粟島駐車場桟橋（静岡県） - 粟島ホテル桟橋［あわしまマリンパーク］（粟島） | | 5分 | 「アワシマ16」 | あわしまマリンパーク |
| FC4 | | 師崎港（愛知県） - 日間賀島北港（日間賀島） | | 20分 | 「しまゆり」 | 名鉄海上観光船 |
| FC5 | | 師崎港（愛知県） - 篠島港（篠島） | | 20分 | 「しまゆり」 | 名鉄海上観光船 |
| FC6 | | 師崎港（愛知県） - 篠島港（篠島） - 日間賀島東港（日間賀島） - 日間賀島西港（日間賀島） - 師崎港（愛知県） | | 20分 | 『はやぶさ』『はやぶさ2』『はやぶさ3』『しらさぎ』『イーグル3』『海鴎1』『海鴎11』『海鴎12』 | 名鉄海上観光船 |
| FC7 | | 伊良湖港（愛知県） - 篠島港（篠島） - 日間賀島東港（日間賀島） - 日間賀島西港（日間賀島） - 河和港（愛知県） | 14.5㎞ | 55分 | 『はやぶさ』『はやぶさ2』『はやぶさ3』『しらさぎ』『イーグル3』『海鴎1』『海鴎11』『海鴎12』 | 名鉄海上観光船 |
| FC8 | 津航路（津ベルライン） | 津なぎさまち［津松阪港］（三重県） - セントレア港（空港島） | | 45分 | 「フェニックス」「カトレア」 | 津エアポートライン |
| FC9 | 鳥羽伊良湖航路（しおさい海道） | 鳥羽港（三重県） - 伊良湖港（愛知県） | 23.2㎞ | 60分 | 「鳥羽丸」「伊勢丸」「知多丸」 | 伊勢湾フェリー |
| FC10 | | 伊良湖港（愛知県） - 神島港（神島） | 5.7㎞ | 15分 | 「かみしま」 | 神島観光汽船 |
| FC11 | 神島航路 | 中之郷港［鳥羽港］（三重県） - 佐田浜港（三重県） - 菅島港（菅島） - 和具港（三重県） - 神島港（神島） | | 50分 | 「しおさい」「かがやき」「きらめき」「第二十五鳥羽丸」「第二十七鳥羽丸」「第二十八鳥羽丸」 | 鳥羽市営定期船 |
| FC12 | 答志航路 | 中之郷港［鳥羽港］（三重県） - 坂手港（坂手島） - 佐田浜港（三重県） - 和具港（三重県） - 答志港（答志島） | | 56分 | 「しおさい」「かがやき」「きらめき」「第二十五鳥羽丸」「第二十七鳥羽丸」「第二十八鳥羽丸」 | 鳥羽市営定期船 |
| FC13 | 桃取航路 | 中之郷港［鳥羽港］（三重県） - 坂手港（坂手島） - 佐田浜港（三重県） - 桃取港（答志島） | | 30分 | 「しおさい」「かがやき」「きらめき」「第二十五鳥羽丸」「第二十七鳥羽丸」「第二十八鳥羽丸」 | 鳥羽市営定期船 |
| FC14 | 菅島航路 | 中之郷港［鳥羽港］（三重県） - 坂手港（坂手島） - 佐田浜港（三重県）- 菅島港（菅島） | | 35分 | 「しおさい」「かがやき」「きらめき」「第二十五鳥羽丸」「第二十七鳥羽丸」「第二十八鳥羽丸」 | 鳥羽市営定期船 |
| FC15 | 坂手航路 | 中之郷港［鳥羽港］（三重県） - 佐田浜港（三重県） - 坂手港（坂手島） | | 23分 | 「しおさい」「かがやき」「きらめき」「第二十五鳥羽丸」「第二十七鳥羽丸」「第二十八鳥羽丸」 | 鳥羽市営定期船 |
| FC16 | あご湾定期航路 | 賢島港（三重県） - 間崎港（間崎島） - 和具港（三重県） | 6.7㎞ | 25分 | 「おくしま」「おおさき」 | 志摩マリンレンジャー |
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